Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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