Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms