Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BEND4Q6ZU67 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BEND4Q6ZU67 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms