Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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LINC00299Q6ZSB3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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LINC00299Q6ZSB3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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