Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLRC1Q6VVB1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLRC1Q6VVB1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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