Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4L3Q6VB84 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms