Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms