Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms