Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms