Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms