Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms