Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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