Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKOR2Q2VWA4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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