Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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