Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms