Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CST6Q15828 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CST6Q15828 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CST6Q15828 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms