Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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SIX1Q15475 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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SIX1Q15475 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SIX1Q15475 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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