Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms