Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HERC3Q15034 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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