Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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PTPRCAPQ14761 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRCAPQ14761 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRCAPQ14761 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRCAPQ14761 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRCAPQ14761 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRCAPQ14761 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRCAPQ14761 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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