Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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