Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms