Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms