Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms