Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms