Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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