Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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