Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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