Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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