Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 HULC-201ENST00000503668 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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