Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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