Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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