Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms