Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CDH17Q12864 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CDH17Q12864 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CDH17Q12864 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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