Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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