Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB40BQ12829 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB40BQ12829 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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