Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms