Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms