Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms