Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms