Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms