Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms