Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms