Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms