Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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