Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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ACTBP60709 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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