Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms