Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL23P55773 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL23P55773 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL23P55773 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms