Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN5P54829 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms