Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
AP3M2P53677 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms